61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1621 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1621    100 
 
 		 748 bp  1483    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.187393  normal  0.334056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2027    95.14 
 
 		 505 bp  452  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1194  normal  0.287327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1949    94.44 
 
 		 609 bp  436  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276274  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  83.06 
 
 		 924 bp  391  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  82.94 
 
 		 924 bp  383  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  82.94 
 
 		 924 bp  383  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4183    82.94 
 
 		 1679 bp  383  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  82.94 
 
 		 924 bp  383  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  82.94 
 
 		 924 bp  383  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  82.27 
 
 		 924 bp  351  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  82.27 
 
 		 924 bp  351  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  82.27 
 
 		 924 bp  351  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  82.27 
 
 		 924 bp  351  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  82.27 
 
 		 924 bp  351  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2137    82.44 
 
 		 923 bp  351  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00245844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  82.11 
 
 		 924 bp  343  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  82.11 
 
 		 924 bp  343  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  82.11 
 
 		 924 bp  343  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  81.94 
 
 		 924 bp  335  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1939    81.61 
 
 		 924 bp  319  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.7341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  81.61 
 
 		 789 bp  319  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  81.34 
 
 		 924 bp  305  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  81.18 
 
 		 924 bp  297  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  81.18 
 
 		 924 bp  297  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  81.18 
 
 		 924 bp  297  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  81.15 
 
 		 924 bp  293  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  81.15 
 
 		 924 bp  293  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  83.61 
 
 		 924 bp  291  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  83.61 
 
 		 924 bp  291  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  82.91 
 
 		 924 bp  285  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  83.14 
 
 		 924 bp  276  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  80.91 
 
 		 597 bp  264  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  80.84 
 
 		 516 bp  238  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0583    83.55 
 
 		 834 bp  198  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0614    83.55 
 
 		 857 bp  198  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  83.17 
 
 		 336 bp  131  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  92.05 
 
 		 432 bp  119  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0125    82.13 
 
 		 268 bp  115  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  98.11 
 
 		 387 bp  97.6  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0135    86.05 
 
 		 707 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  85.23 
 
 		 921 bp  71.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  85.23 
 
 		 921 bp  71.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  84.71 
 
 		 921 bp  65.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2178    90.57 
 
 		 323 bp  65.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0241092  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  84.71 
 
 		 921 bp  65.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  84.71 
 
 		 921 bp  65.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  84.71 
 
 		 921 bp  65.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05652  hypothetical protein  84.71 
 
 		 132 bp  65.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  84.09 
 
 		 921 bp  63.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  82.95 
 
 		 870 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  82.95 
 
 		 921 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  82.95 
 
 		 921 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  82.95 
 
 		 849 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  82.95 
 
 		 921 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  82.95 
 
 		 921 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  82.95 
 
 		 921 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  82.95 
 
 		 921 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  82.95 
 
 		 921 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  82.95 
 
 		 303 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  82.95 
 
 		 921 bp  56  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  84.51 
 
 		 921 bp  54  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>