14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0626 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 896 aa  1821    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  23.09 
 
 		 1004 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.25 
 
 		 911 aa  67.4  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.38 
 
 		 1868 aa  55.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1474 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2000  hypothetical protein  26.5 
 
 		 768 aa  53.5  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.91 
 
 		 1443 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1807 aa  50.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.37 
 
 		 1557 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1065 aa  49.7  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.12 
 
 		 1831 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  24.4 
 
 		 873 aa  48.5  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  20.31 
 
 		 1766 aa  48.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.73 
 
 		 911 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>