38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3610 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  91.53 
 
 		 354 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  91.24 
 
 		 354 aa  675    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  98.02 
 
 		 354 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  91.24 
 
 		 365 aa  681    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 354 aa  736    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 354 aa  736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  91.53 
 
 		 354 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  96.53 
 
 		 346 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  91.53 
 
 		 354 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  73.3 
 
 		 358 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  71.31 
 
 		 355 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  73.73 
 
 		 355 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  72.24 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  70.45 
 
 		 354 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  59.6 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  47.41 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  43.44 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  34.08 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  36.01 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  35.41 
 
 		 364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  33.71 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  34.67 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  35.84 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  35.43 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  34.67 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  33.43 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  29.25 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  29.56 
 
 		 371 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  30.86 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  28.34 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  26.59 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  33.33 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  31.08 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>