87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2565 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2565  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  278  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2632  hypothetical protein  98.48 
 
 
132 aa  273  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2740  hypothetical protein  97.71 
 
 
132 aa  271  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1430  hypothetical protein  88.46 
 
 
132 aa  248  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.69 
 
 
140 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.33 
 
 
140 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0443  hypothetical protein  50.39 
 
 
135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.864422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0020  hypothetical protein  55.73 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.528781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4098  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.91 
 
 
139 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7115  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.61 
 
 
135 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599769  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5249  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.59 
 
 
140 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000066738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1750  hypothetical protein  51.97 
 
 
135 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634592  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.62 
 
 
136 aa  141  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0884079  normal  0.141293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0233  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.82 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4432  lactoylglutathione lyase  51.97 
 
 
135 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.67 
 
 
141 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.03 
 
 
138 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0892969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.4 
 
 
134 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2061  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.78 
 
 
134 aa  133  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0265645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.82 
 
 
138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.67 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.225556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3983  hypothetical protein  47.24 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.286993 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.61 
 
 
138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.61 
 
 
138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4550  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.61 
 
 
138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.482382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.16 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0454203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.96 
 
 
138 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.384349  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.83 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587684  normal  0.324112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.62 
 
 
135 aa  126  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.990227  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0419  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.62 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4348  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.03 
 
 
154 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1706  lactoylglutathione lyase-like protein  41.73 
 
 
136 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.44 
 
 
138 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.56 
 
 
137 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4926  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.45 
 
 
138 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0545441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0232716  normal  0.29911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08170  predicted lactoylglutathione lyase  45.53 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.913162  normal  0.0778281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1263  hypothetical protein  45.74 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3250  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.46 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.395737  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3933  hypothetical protein  43.08 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00670375  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 
141 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1009  hypothetical protein  41.73 
 
 
143 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  43.08 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1709  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.21 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2327  lactoylglutathione lyase  42.52 
 
 
135 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200083  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2354  hypothetical protein  40.16 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 
135 aa  106  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1060  hypothetical protein  42.98 
 
 
121 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.31 
 
 
138 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2857  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
144 aa  100  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000230287  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
144 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6209  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.84 
 
 
147 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.954751  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4515  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.93 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1780  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630756  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1420  hypothetical protein  35.11 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0362155  normal  0.0872758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4499  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.94 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0899867  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3489  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 
140 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.990759  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1441  hypothetical protein  32.33 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.3 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.33915  decreased coverage  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4147  putative glyoxalase family protein  38.89 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2818  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21560  predicted lactoylglutathione lyase  27.48 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.697141  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0390  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.79 
 
 
145 aa  50.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2342  hypothetical protein  32.26 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2038  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
144 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3728  glyoxalase family protein  24.63 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2653  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3083  glyoxalase family protein  25.4 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.76 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1291  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000859167  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4513  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
140 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3214  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 
277 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000855792  normal  0.159914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0279674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.6 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.243786  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.728322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>