28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0779 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0779  response regulator receiver protein  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3244  response regulator receiver protein  95.18 
 
 		 249 aa  470  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3347  transcriptional regulator  84.74 
 
 		 249 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.730311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0936  transcriptional regulator  45.97 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0879  hypothetical protein  28.29 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0881  putative transcriptional regulator, CadC  27.31 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3240  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.8 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0783  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.8 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3343  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.8 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0880  transcriptional regulator, CadC  27.17 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0653  hypothetical protein  26.38 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0940  transcriptional regulator-related protein  26 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  27.45 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3438  winged helix family two component response transcriptional regulator  24.9 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0757  putative transcriptional regulator, CadC  34.71 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0883  response regulator receiver protein  21.79 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0885  transcriptional regulator, CadC  25.3 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3459  transcriptional regulator, CadC  22.8 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0833  transcriptional regulator, CadC  22.8 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3534  transcriptional regulator, CadC  22.8 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3632  response regulator receiver protein  24.8 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3653  transcriptional regulator, CadC  22.4 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.409424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0793  putative transcriptional regulator, CadC  19.41 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.790637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2752  hypothetical protein  32.84 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0760  response regulator receiver protein  21.22 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4496  two-component response regulator  39.13 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03550  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.18 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>