38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3807 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  90.4 
 
 
354 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  90.11 
 
 
354 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
354 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  90.68 
 
 
365 aa  675    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  98.02 
 
 
354 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  98.02 
 
 
354 aa  724    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  90.4 
 
 
354 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  96.24 
 
 
346 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  90.4 
 
 
354 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  73.45 
 
 
358 aa  554  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  70.9 
 
 
355 aa  531  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  73.45 
 
 
355 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  71.23 
 
 
354 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  70.34 
 
 
354 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  59.04 
 
 
356 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  47.68 
 
 
402 aa  335  9e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  43.15 
 
 
361 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  33.52 
 
 
368 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  35.14 
 
 
385 aa  222  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  36.44 
 
 
364 aa  222  8e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
382 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
352 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
347 aa  216  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  34.38 
 
 
370 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  35.84 
 
 
348 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  34.1 
 
 
359 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  33.14 
 
 
372 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  34.1 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  30.08 
 
 
382 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  32.77 
 
 
376 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  29.83 
 
 
371 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  31.14 
 
 
372 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  27.48 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  26.88 
 
 
387 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 
356 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  28.97 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  23.94 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  32.29 
 
 
320 aa  42.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>