31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3667 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  96.58 
 
 		 292 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  95.89 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  87.33 
 
 		 292 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  78.08 
 
 		 292 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  74.32 
 
 		 292 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  74.32 
 
 		 292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  73.63 
 
 		 292 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  73.97 
 
 		 292 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  58.16 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  54.64 
 
 		 301 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  51.89 
 
 		 293 aa  291  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  51.76 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  50.52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  48.81 
 
 		 292 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  50.52 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  32.39 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  33.33 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  33.69 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  31.52 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  28.04 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  29.34 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  30.73 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  27.05 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  27.86 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  27.17 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  28.36 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  24.58 
 
 		 482 aa  53.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  25.73 
 
 		 481 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2701  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.05 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.942967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  23.2 
 
 		 553 aa  43.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>