32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3313 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  87.11 
 
 		 481 aa  848    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  71.37 
 
 		 472 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  86.9 
 
 		 481 aa  846    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  967    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  87.53 
 
 		 473 aa  838    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  97.25 
 
 		 474 aa  920    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  97.03 
 
 		 474 aa  936    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  70.7 
 
 		 474 aa  680    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  87.32 
 
 		 481 aa  849    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  87.32 
 
 		 481 aa  850    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  94.73 
 
 		 474 aa  893    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  71.77 
 
 		 474 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  71.9 
 
 		 475 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  70.69 
 
 		 461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  59.21 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  41.28 
 
 		 425 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  40.87 
 
 		 425 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  39.01 
 
 		 417 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  40.24 
 
 		 443 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  39.66 
 
 		 444 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  40.74 
 
 		 443 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  33.16 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  33.16 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  30.13 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  21.64 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  21.24 
 
 		 395 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  21.24 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.17 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.64 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.3 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  27.55 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0072  thioredoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>