26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3593 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0249  hypothetical protein  86.08 
 
 		 238 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0248  hypothetical protein  83.97 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000693847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3953  hypothetical protein  74.04 
 
 		 235 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00215656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3755  hypothetical protein  73.62 
 
 		 235 aa  347  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.728885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4144  hypothetical protein  73.62 
 
 		 235 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0190  hypothetical protein  73.62 
 
 		 235 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0191  hypothetical protein  73.19 
 
 		 235 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4277  hypothetical protein  73.19 
 
 		 235 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.394205  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3828  hypothetical protein  73.19 
 
 		 235 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000637636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3961  hypothetical protein  73.31 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0320  hypothetical protein  73.62 
 
 		 235 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4560  hypothetical protein  72.8 
 
 		 263 aa  322  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0288  hypothetical protein  71.19 
 
 		 240 aa  304  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3497  hypothetical protein  67.37 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000878688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3452  hypothetical protein  68.7 
 
 		 233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  26.96 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  27.39 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  28.66 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1153  hypothetical protein  29.15 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  25.85 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12700  hypothetical protein  29.6 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0916578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4927  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  26.09 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  26.09 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  25.65 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>