19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3212 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  100 
 
 		 164 aa  345  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  63.19 
 
 		 165 aa  228  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  48.48 
 
 		 184 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  50.63 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  50.63 
 
 		 170 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  50.63 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  50 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  52.7 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  42.41 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  38.56 
 
 		 163 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  36.77 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  36.6 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  36.77 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  36.13 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  36.02 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  32.28 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  23.87 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 586 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3731  hypothetical protein  29.9 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>