66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1697 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  79.27 
 
 		 164 aa  270  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  75.3 
 
 		 166 aa  253  9e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  70.73 
 
 		 166 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  74.07 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  69.14 
 
 		 166 aa  234  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  67.28 
 
 		 166 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  67.28 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.52 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.52 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.52 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  68.52 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  66.67 
 
 		 166 aa  227  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  68.29 
 
 		 166 aa  227  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  65.43 
 
 		 168 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  64.2 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.54 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  36.14 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  34.73 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  34.73 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  35.71 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  34.97 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  34.13 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.82 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  34.13 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.72 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  29.09 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.1 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  32.1 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  34.57 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.72 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  26.83 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  29.88 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.14 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  31.93 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  32.94 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  30.86 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.44 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.12 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  28.22 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  25.16 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  26.45 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  27.78 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  31.72 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.81 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.74 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.47 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  26.87 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3629  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  22.75 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  22.64 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  31.2 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.47 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02738  hypothetical protein  23.08 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  27.05 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0869  hypothetical protein  23.19 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00598997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3434  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  21.34 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00127  glycine cleavage system transcriptional repressor  25 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0355979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  25.58 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1510  amino acid-binding ACT domain protein  25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0143098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  21.52 
 
 		 177 aa  44.3  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3623  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.4 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.18 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.33 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.74 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  29.91 
 
 		 185 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.8 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>