31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3500 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  99.38 
 
 
481 aa  968    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  69.43 
 
 
472 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  99.17 
 
 
481 aa  969    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  87.11 
 
 
474 aa  810    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  85.8 
 
 
473 aa  843    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  87.73 
 
 
474 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  87.97 
 
 
474 aa  847    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  70.19 
 
 
474 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  975    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  98.75 
 
 
481 aa  961    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  87.94 
 
 
474 aa  829    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  71.73 
 
 
474 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  71.02 
 
 
475 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  68.78 
 
 
461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  60.26 
 
 
479 aa  528  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  41.44 
 
 
425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  40.43 
 
 
425 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  38.84 
 
 
417 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  40.14 
 
 
443 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  39.71 
 
 
444 aa  250  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  39.74 
 
 
443 aa  242  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  33.59 
 
 
405 aa  187  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  33.58 
 
 
382 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  30.1 
 
 
409 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  22.28 
 
 
406 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.22 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  19.96 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  19.51 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.48 
 
 
379 aa  58.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  25.3 
 
 
377 aa  50.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.14 
 
 
373 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>