44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3166 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  94.87 
 
 
156 aa  304  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  92.31 
 
 
156 aa  299  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  88.46 
 
 
156 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  77.86 
 
 
165 aa  221  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  51.91 
 
 
133 aa  140  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  50.38 
 
 
133 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  51.15 
 
 
133 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2225  hypothetical protein  53.17 
 
 
131 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  51.15 
 
 
140 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0787  hypothetical protein  51.94 
 
 
133 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0827  hypothetical protein  51.94 
 
 
133 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000717124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  51.16 
 
 
133 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  49.61 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  49.61 
 
 
133 aa  130  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  49.22 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  50.42 
 
 
130 aa  120  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  51.58 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  50.98 
 
 
130 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  50.98 
 
 
130 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  50.98 
 
 
130 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  49.02 
 
 
130 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  49.02 
 
 
130 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  41.46 
 
 
129 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  39.5 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4379  hypothetical protein  49.49 
 
 
130 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.73238e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5481  hypothetical protein  48.48 
 
 
130 aa  91.3  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0281  hypothetical protein  48.48 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.106123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  36.11 
 
 
359 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  29.27 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  29.27 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.27 
 
 
131 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  28.7 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  27.56 
 
 
1420 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.46 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  25.71 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  23.44 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.13 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  23.44 
 
 
134 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  28.09 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>