16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2239 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  98.3 
 
 		 353 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2239  HNH nuclease  100 
 
 		 353 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2355  HNH nuclease  97.45 
 
 		 353 aa  720    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  98.3 
 
 		 353 aa  724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  66.76 
 
 		 374 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  40.7 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4564  HNH nuclease  37.36 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  36.39 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  36.89 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  36.63 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  28.52 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 586 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0924  hypothetical protein  34.83 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  22.64 
 
 		 551 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 585 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>