64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0583 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  91.57 
 
 
924 bp  1100    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  91.81 
 
 
924 bp  1116    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0583    100 
 
 
834 bp  1653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  91.57 
 
 
924 bp  1100    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  91.69 
 
 
924 bp  1108    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
336 bp  666    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  91.81 
 
 
924 bp  1116    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  91.81 
 
 
924 bp  1116    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  91.69 
 
 
924 bp  1108    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  91.47 
 
 
789 bp  969    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1939    91.45 
 
 
924 bp  1092    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.7341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  91.57 
 
 
924 bp  1100    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  91.57 
 
 
924 bp  1100    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  91.69 
 
 
924 bp  1108    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  91.69 
 
 
924 bp  1108    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  91.45 
 
 
924 bp  1092    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  91.33 
 
 
924 bp  1084    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  91.45 
 
 
924 bp  1092    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  91.57 
 
 
924 bp  1100    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  91.21 
 
 
924 bp  1076    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  91.21 
 
 
924 bp  1076    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  91.57 
 
 
924 bp  1100    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  91.45 
 
 
924 bp  1092    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0614    100 
 
 
857 bp  1653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  91.33 
 
 
924 bp  1084    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  91.45 
 
 
924 bp  1092    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4183    91.57 
 
 
1679 bp  1100    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  91.33 
 
 
924 bp  1084    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2137    90.74 
 
 
923 bp  1037    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00245844  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  91.33 
 
 
924 bp  1084    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  90.15 
 
 
597 bp  632  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  84.6 
 
 
924 bp  617  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  95.07 
 
 
432 bp  577  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  89.55 
 
 
516 bp  561  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  94.67 
 
 
387 bp  494  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2027    84.22 
 
 
505 bp  319  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1194  normal  0.287327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0611  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
138 bp  274  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.337264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1949    83.2 
 
 
609 bp  246  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276274  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1621    83.55 
 
 
748 bp  198  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.187393  normal  0.334056 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0125    81.5 
 
 
268 bp  109  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2178    83.8 
 
 
323 bp  109  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0241092  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0135    81.37 
 
 
707 bp  87.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  94.12 
 
 
921 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  94.12 
 
 
921 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05652  hypothetical protein  94.12 
 
 
132 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  94.12 
 
 
921 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  94.12 
 
 
921 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  84.38 
 
 
909 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  84.38 
 
 
303 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  84.38 
 
 
903 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  84.38 
 
 
870 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  84.38 
 
 
849 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  84.38 
 
 
921 bp  48.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>