20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08470 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08470  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.498792  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0017  tRNA-Glu  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0883282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05810  tRNA-Glu  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00953031  hitchhiker  0.00213851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0043  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0051  tRNA-Glu  87.88 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0046    88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0515683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0007  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0013  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000540614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0048  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA34  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0006  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  85.51 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0008  tRNA-Glu  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.862218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0041  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0041  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0020  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00671129  hitchhiker  0.00000169389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0040  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.284768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>