40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07990 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_07990  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  223  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2540  protein of unknown function DUF322  51.35 
 
 
115 aa  124  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05240  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0469  hypothetical protein  40.34 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0486821  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1222  protein of unknown function DUF322  38.95 
 
 
116 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  32.69 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  34.29 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  33.87 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  30.1 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  36.89 
 
 
149 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  31.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1714  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.353147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  30.51 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  29.81 
 
 
130 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  32.35 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  25.71 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  25.71 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  30 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  37 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1040  protein of unknown function DUF322  29.06 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  34.91 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  25 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1239  hypothetical protein  32.56 
 
 
191 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  43.9  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  32.69 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  32.08 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1040  protein of unknown function DUF322  30.19 
 
 
148 aa  42.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000237836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  33.98 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  33.02 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  29.82 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  33.01 
 
 
237 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  25.96 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  24.49 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  26.92 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  34.17 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  31.11 
 
 
118 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  29.81 
 
 
116 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>