26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0469 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0469  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  238  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0486821  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2540  protein of unknown function DUF322  36.75 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05240  hypothetical protein  36.75 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07990  hypothetical protein  40.65 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  24.32 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  30.91 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2509  hypothetical protein  24.32 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  27.27 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  27.27 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3995  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000107112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3616  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000485784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3598  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.6047e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3899  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3905  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3956  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1287  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400047  hitchhiker  0.00000103089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3871  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.27475e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3708  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3680  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000589805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  21.43 
 
 
120 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  27.93 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  31.86 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  26.05 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0697  hypothetical protein  27.73 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0226225  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  26.5 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  33.96 
 
 
153 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>