35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06380  PAP2 superfamily protein  100 
 
 
167 aa  333  3.9999999999999995e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.538569  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01550  PAP2 superfamily protein  44.24 
 
 
172 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.97 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00441187  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0264  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.37 
 
 
161 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1718  PAP2 family protein  32.26 
 
 
166 aa  100  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.300286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.91 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.68 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.56 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  30.19 
 
 
358 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0037  PAP2 family protein  28.12 
 
 
245 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.01 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.17 
 
 
255 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.82 
 
 
176 aa  44.3  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.93 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.62 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.09 
 
 
273 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  32.08 
 
 
359 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  32.08 
 
 
359 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.76 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.81 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.7 
 
 
279 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.77 
 
 
256 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1018  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.09 
 
 
220 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.76 
 
 
194 aa  41.6  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  30.7 
 
 
364 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  26.04 
 
 
182 aa  41.2  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0979  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  40.54 
 
 
253 aa  41.2  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.626703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.88 
 
 
186 aa  40.8  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.4 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.97 
 
 
272 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  26.05 
 
 
271 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.93 
 
 
172 aa  40.8  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.41 
 
 
220 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  26.05 
 
 
274 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>