53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1655 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  100 
 
 		 120 aa  246  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  44.17 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0698  DsrE family protein  34.17 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3594  hypothetical protein  32.5 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721158  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1263  hypothetical protein  30.83 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.597675  normal  0.0357091 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  33.33 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  31.36 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  31.37 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  26.05 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  27 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3936  DsrE-like protein  34.82 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1964  hypothetical protein  29.51 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.562299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1900  hypothetical protein  29.51 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1906  protein YchN  29.51 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1554  hypothetical protein  29.51 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1370  protein YchN  29.51 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  26.89 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  28.44 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1386  dsrE family protein  29.51 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1921  dsrE family protein  29.51 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.381334  normal  0.076229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2404  DsrE family protein  29.51 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154243 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2427  DsrE family protein  29.51 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1369  dsrE family protein  29.51 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0957113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1327  dsrE family protein  29.51 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.547  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01207  hypothetical protein  29.51 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01197  hypothetical protein  29.51 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1702  dsrE family protein  29.51 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.927343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  30.28 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4198  DsrE family protein  28.16 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2327  DsrE family protein  27.87 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3648  DsrE family protein  27.93 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0159221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3844  DsrE family protein  27.93 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.782549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0296  DsrE family protein  27.93 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2882  hypothetical protein  32.56 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3065  DsrE family protein  32.56 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.618482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3205  DsrE family protein  32.56 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  32.43 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  27.97 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  25.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  28.44 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1129  DsrE family protein  32.04 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000155776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  30.28 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  25.47 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0325  dsrE-related protein  27.03 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3964  DsrE family protein  29.11 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  28.16 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  28.04 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  27 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4066  DsrE family protein  27.85 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3662  DsrE family protein  27.03 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0438374  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4041  DsrE family protein  27.85 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>