18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3611 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3611  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00237944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0119  hypothetical protein  62.2 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0114  hypothetical protein  61.72 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4240  hypothetical protein  61.72 
 
 		 208 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0118  hypothetical protein  61.72 
 
 		 208 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0110  hypothetical protein  56.67 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0114  hypothetical protein  59.81 
 
 		 203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0115  hypothetical protein  59.81 
 
 		 213 aa  231  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0115  hypothetical protein  59.81 
 
 		 206 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.651645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0110  hypothetical protein  59.81 
 
 		 206 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4836  hypothetical protein  42.17 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4162  hypothetical protein  43.48 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0085  hypothetical protein  45.67 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4444  hypothetical protein  41.3 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3754  hypothetical protein  43.72 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002052  hypothetical protein  32.41 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00396  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2478  hypothetical protein  25.75 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>