20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2083 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1277    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.999521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2303  hypothetical protein  73.58 
 
 		 678 aa  955    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00124  hypothetical protein  57 
 
 		 622 aa  717    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0313  hypothetical protein  36.12 
 
 		 746 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1022 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  35.6 
 
 		 853 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1016  hypothetical protein  34.42 
 
 		 664 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  34.63 
 
 		 664 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2116  hypothetical protein  39.47 
 
 		 507 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.539609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1219  hypothetical protein  34.2 
 
 		 693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  32.9 
 
 		 759 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1399  hypothetical protein  36.38 
 
 		 487 aa  280  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0168  hypothetical protein  30.73 
 
 		 483 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2115  Peptidase M15A  50 
 
 		 358 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4496  hypothetical protein  29.61 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  36.59 
 
 		 268 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  33.61 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 289 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  35.9 
 
 		 284 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  32.93 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>