31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0312 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  980    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  58.51 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  58.47 
 
 		 472 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  59.36 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  58.97 
 
 		 481 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  58.88 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  58.97 
 
 		 481 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  58.68 
 
 		 481 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  58.85 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  59.28 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  56.67 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  61.22 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  61.59 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  61.05 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  58.3 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  40.95 
 
 		 425 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  41.87 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  42.59 
 
 		 425 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  40.59 
 
 		 444 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  41.41 
 
 		 443 aa  259  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  39.74 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  32.43 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  30.94 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  31.53 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  24.44 
 
 		 406 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  19.01 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  19.02 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.67 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.17 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.55 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  28.07 
 
 		 377 aa  50.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>