20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4368 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4368  integrase, catalytic region  100 
 
 
42 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  88.57 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  88.57 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  88.57 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  88.57 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  73.68 
 
 
346 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  74.29 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  68.57 
 
 
346 aa  60.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  68.57 
 
 
346 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  68.57 
 
 
346 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  68.57 
 
 
346 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  68.57 
 
 
346 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  68.57 
 
 
346 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  70 
 
 
347 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  70 
 
 
347 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  70 
 
 
347 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  70 
 
 
347 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  70 
 
 
347 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  70 
 
 
347 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  70 
 
 
344 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>