66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2854 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 
192 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  84.9 
 
 
273 aa  343  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  85.94 
 
 
192 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  85.42 
 
 
192 aa  339  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  84.9 
 
 
192 aa  339  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  85.42 
 
 
192 aa  337  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  46.38 
 
 
213 aa  184  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  43.96 
 
 
217 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  45.32 
 
 
213 aa  171  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  45.93 
 
 
211 aa  171  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  44.06 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  45.05 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  41.71 
 
 
211 aa  158  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  43.39 
 
 
194 aa  154  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  41.63 
 
 
211 aa  151  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  42.11 
 
 
211 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  41.88 
 
 
193 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  38.5 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  40 
 
 
193 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  36.92 
 
 
205 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  35.57 
 
 
241 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  35.57 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  34.26 
 
 
221 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  33.16 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  30.92 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  36.9 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  34.9 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  35 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  34.62 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  58.33 
 
 
119 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  31.33 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  56.94 
 
 
84 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  56.94 
 
 
84 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  27.23 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  27.23 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  26.18 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  26.18 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  26.2 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  28.65 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  28.39 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  30 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  30 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  32.46 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  29.14 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  26.23 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  27.4 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  28.89 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  27.7 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  27.03 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  24.6 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  27.15 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  28.48 
 
 
301 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  26.49 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  25 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  32.38 
 
 
145 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  25.29 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  25 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  35.06 
 
 
125 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  28.93 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  29.91 
 
 
157 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  26.92 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  29.49 
 
 
504 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2384  Phage-related baseplate assembly protein V  34.65 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  22.88 
 
 
210 aa  48.5  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3333  Phage-related baseplate assembly protein V  33.66 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1139  Phage baseplate assembly protein V  28.1 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>