41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1183 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1183  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  460  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0404  hypothetical protein  37.19 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1452  hypothetical protein  34.31 
 
 		 357 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1633  hypothetical protein  34.31 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1794  hypothetical protein  33.82 
 
 		 357 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.863459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0772  hypothetical protein  34.27 
 
 		 366 aa  108  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1029  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit B  28.34 
 
 		 325 aa  89  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.77588  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1008  hypothetical protein  31.52 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.491762  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1043  hypothetical protein  28.88 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.838471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2103  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  23.5 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0211  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  25.83 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0173  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  26.36 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.394004  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5285  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  22.63 
 
 		 370 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0784  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  22.22 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0404  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  25.2 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0395  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  25.2 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3786  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  22.59 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167628  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5498  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  25.64 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692579 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0762  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  23.77 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29780  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  26.98 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1699  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  27.12 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1438  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  21.85 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.289291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5330  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  23.81 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0376  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  27.69 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6095  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  23.93 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2969  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  22.54 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.658603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1383  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  22.54 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2882  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  22.54 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1787  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  23.39 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.177306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1654  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  21.37 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.224202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1323  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  23.93 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0573878  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6506  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  23.93 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0769  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  24.67 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3513  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  29.31 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2911  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  21.49 
 
 		 238 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.327846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1613  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  27.59 
 
 		 234 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.954242  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2128  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  25.33 
 
 		 236 aa  41.6  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0886  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  20.34 
 
 		 253 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002236  succinate dehydrogenase iron-sulfur protein  21.95 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0313  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  23.18 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2270  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  22.22 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0879984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>