17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1091 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  100 
 
 
853 aa  1725    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1887  hypothetical protein  27.61 
 
 
849 aa  317  7e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1133  hypothetical protein  26.1 
 
 
856 aa  303  9e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0819  hypothetical protein  25.34 
 
 
856 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  26.61 
 
 
856 aa  281  4e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1090  hypothetical protein  27.57 
 
 
821 aa  281  5e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  27.07 
 
 
843 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  28.37 
 
 
655 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1400  hypothetical protein  26.83 
 
 
843 aa  270  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.71275  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  32.11 
 
 
921 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  30 
 
 
1061 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  29.67 
 
 
1061 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  27.47 
 
 
1079 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  19.62 
 
 
1070 aa  51.2  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  21.97 
 
 
1094 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  23.5 
 
 
1234 aa  47.8  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  25.27 
 
 
1104 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>