17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0122 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
378 aa  775    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0238  hypothetical protein  29.92 
 
 
375 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.282565  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1697  type IV pilus assembly protein PilZ  28.57 
 
 
360 aa  135  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00195007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0984  type IV pilus assembly protein PilZ  34.84 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0403  type IV pilus assembly PilZ  27.27 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0929712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  26.11 
 
 
232 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  25.62 
 
 
232 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  25.96 
 
 
236 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  29.25 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  26.26 
 
 
235 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1679  type IV pilus assembly PilZ  25.66 
 
 
237 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00152995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  26.26 
 
 
235 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  22.17 
 
 
234 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  25.7 
 
 
238 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  24.63 
 
 
239 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  28.93 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1281  type IV pilus assembly PilZ  19.82 
 
 
629 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>