60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3997 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3997  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4304  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10841  hypothetical protein  29.13 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0119  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1863  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1602  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000575881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7312  hypothetical protein  31.03 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5211  putative acetyltransferase  34.29 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 		 144 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 		 144 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0369  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2761  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.30165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5520  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.890921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 		 149 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2623  acetyltransferase, GNAT family  23.65 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000303588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 160 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2688  acetyltransferase, GNAT family  28.05 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1439  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2208  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000485464 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5753  GCN5-related N-acetyltransferase  28.09 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  39.13 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1239  acetyltransferase  33.33 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2473  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 		 94 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0576  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0543356 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0134  acetyltransferase  34.62 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1643  acetyltransferase  34.62 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  22.95 
 
 		 144 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2681  acetyltransferase, GNAT family  22.3 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000458836 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1562  acetyltransferase  34.62 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0736  acetyltransferase  34.18 
 
 		 411 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2414  acetyltransferase  22.3 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0117  hypothetical protein  19.77 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3134  acetyltransferase  34.18 
 
 		 411 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2844  acetyltransferase, GNAT family  26.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0189947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2732  acetyltransferase, GNAT family  22.97 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117316  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  35.53 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0460  acetyltransferase  27.06 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0103  hypothetical protein  19.77 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 141 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0103  acetyltransferase  34.18 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.864372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1486  acetyltransferase  34.18 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0553  acetyltransferase  34.18 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 141 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2915  acetyltransferase  34.18 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0569  acetyltransferase  34.18 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>