23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2218 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  100 
 
 		 157 aa  318  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  36.03 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  36.03 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  33.09 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  32.35 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  31.62 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  30.88 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  30.88 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  30.88 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0921  FlgN family protein  24.65 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  28.47 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0968  hypothetical protein  28.1 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  29.84 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1173  FlgN family protein  22.38 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0938  hypothetical protein  28.1 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  29.03 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0525  FlgN family protein  26.39 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0746  FlgN  28.97 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0888  FlgN family protein  29.41 
 
 		 159 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0650773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3731  flagella synthesis protein FlgN  29.03 
 
 		 154 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  25.56 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  29.58 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1479  FlgN  28.22 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>