17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3471 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  92.72 
 
 		 151 aa  286  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  61.49 
 
 		 154 aa  180  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  60.84 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  52.03 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  30.53 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  27.56 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  30.23 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000743  LfgN  31.65 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  29.37 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  32.48 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  32.48 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  32.48 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  29.84 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17150  hypothetical protein  25.62 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0235  hypothetical protein  21.21 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  28.35 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>