14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4411 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  294  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  28.35 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  29.01 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  27.56 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  26.45 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  25.76 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  25.6 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  30.99 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3599  ATPases involved in pili biogenesis, PilT  24.22 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  27.82 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  27.82 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  27.82 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0235  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>