18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3974 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  92.72 
 
 
151 aa  286  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  60.81 
 
 
154 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  60.84 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  53.1 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  29.77 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  28.35 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000743  LfgN  30.94 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  29.46 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  29.23 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  29.23 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  28.57 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  29.23 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  29.03 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  29.32 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  29.32 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17150  hypothetical protein  25.62 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0525  FlgN family protein  30.49 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>