11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1969 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1969  zinc metalloproteinase Mpr protein  100 
 
 		 282 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2747  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.56 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3892  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.49 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472555  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0345  zinc metalloproteinase Mpr protein  34.54 
 
 		 306 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.22412  normal  0.306363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0542  hypothetical protein  49.04 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7399  zinc metalloproteinase Mpr protein  32.35 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6488  hypothetical protein  43.4 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6567  hypothetical protein  42.14 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0238  hypothetical protein  40.49 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02022  zinc metalloproteinase Mpr protein  34.72 
 
 		 184 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02021  zinc metalloproteinase Mpr protein  47.83 
 
 		 59 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.462142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>