23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0203 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0203  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  745    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  34.58 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2515  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.95 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.01 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.94 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2512  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.45 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.94 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4040  hypothetical protein  32 
 
 		 395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0333  hypothetical protein  26.73 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  30.16 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  30.16 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  30.16 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  30.16 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  30.16 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.21 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  28.18 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.97 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  24 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.91 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.46 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  24.53 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>