31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3428 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  99.17 
 
 
481 aa  966    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  69.07 
 
 
472 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  98.54 
 
 
481 aa  959    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  87.11 
 
 
474 aa  811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  85.8 
 
 
473 aa  844    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  87.73 
 
 
474 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  87.97 
 
 
474 aa  849    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  69.98 
 
 
474 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  98.75 
 
 
481 aa  961    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  976    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  87.94 
 
 
474 aa  831    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  71.95 
 
 
474 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  70.59 
 
 
475 aa  628  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  69 
 
 
461 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  59.96 
 
 
479 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  41.44 
 
 
425 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  40.43 
 
 
425 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  38.84 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  39.66 
 
 
443 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  39.71 
 
 
444 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  40 
 
 
443 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  33.33 
 
 
405 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  33.58 
 
 
382 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  31.23 
 
 
409 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  22.52 
 
 
406 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.92 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  19.64 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  19.86 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.23 
 
 
379 aa  56.6  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.33 
 
 
373 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  27.12 
 
 
377 aa  47  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>