26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0191 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0191  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4277  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.394205  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4144  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0190  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3755  hypothetical protein  89.79 
 
 
235 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.728885  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3828  hypothetical protein  90.21 
 
 
235 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000637636  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3953  hypothetical protein  89.79 
 
 
235 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00215656  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0320  hypothetical protein  91.06 
 
 
235 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4560  hypothetical protein  86.81 
 
 
263 aa  384  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0249  hypothetical protein  73.73 
 
 
238 aa  343  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3593  hypothetical protein  73.19 
 
 
241 aa  341  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0248  hypothetical protein  71.06 
 
 
237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000693847  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3497  hypothetical protein  71.43 
 
 
236 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000878688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3961  hypothetical protein  67.1 
 
 
244 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0288  hypothetical protein  72.29 
 
 
240 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3452  hypothetical protein  73.82 
 
 
233 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  26.07 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  26.5 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  29.27 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4927  hypothetical protein  27.54 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1153  hypothetical protein  24.78 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  25.33 
 
 
218 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12700  hypothetical protein  25.22 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0916578  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  24.89 
 
 
218 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  23.56 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  24.89 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>