24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0032 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0032  Aec51  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  86.17 
 
 		 225 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  85.11 
 
 		 225 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  85.11 
 
 		 225 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  85.11 
 
 		 225 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  85.11 
 
 		 225 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  85.11 
 
 		 225 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  41.54 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 505 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  40.32 
 
 		 512 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  40.32 
 
 		 512 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  40.32 
 
 		 512 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  42.37 
 
 		 512 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  40.68 
 
 		 458 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  38.98 
 
 		 385 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  32.05 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  32.05 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  32.05 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  32.05 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  31.03 
 
 		 539 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  32.81 
 
 		 517 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3381  hypothetical protein  44.07 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  42.62 
 
 		 472 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 513 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>