25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3894 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4047  hypothetical protein  35.23 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  35.11 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  36.67 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  36.67 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  36.62 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  30.11 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  33.72 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  30.34 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  27.96 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  35.62 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  32.26 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  35.37 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  27.96 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  32.26 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  33.7 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  28.72 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  28.72 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  28.72 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  34.94 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  32.26 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  31.75 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  29.79 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>