26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1482 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1482  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3632  hypothetical protein  30.32 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3283  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2371  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000292572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000569  predicted transcriptional regulator  27.43 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3619  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05315  hypothetical protein  22.82 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1901  XRE family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00769  protein containing HTH domain  27.54 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3581  XRE family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.367106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4061  helix-turn-helix domain-containing protein  26.7 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.859423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4174  XRE family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.383217  normal  0.0580718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4193  XRE family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177463  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3343  helix-turn-helix domain-containing protein  25.86 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4499  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3530  hypothetical protein  25.73 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0307  helix-turn-helix domain-containing protein  23.43 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1857  XRE family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0535  XRE family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01350  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0454  XRE family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.154754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3062  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3879  XRE family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.478998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3152  helix-turn-helix domain protein  22.29 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.769189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5081  helix-turn-helix domain protein  23.67 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3109  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>