13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1465 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1465  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  315  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.726298  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  48.65 
 
 
190 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  32.14 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  31.11 
 
 
209 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2805  hypothetical protein  28.02 
 
 
243 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00093788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  30.28 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  28.19 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  28.46 
 
 
208 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  25.35 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.23 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  25.76 
 
 
450 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0326  hypothetical protein  26.81 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316527  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  29.6 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>