21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4473 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  87.79 
 
 		 311 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  50.41 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  41.95 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  39.71 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.5 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.5 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.5 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  30.26 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  27.55 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  30.43 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  29.41 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  30 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  25.73 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  25.73 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  25.73 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  27.15 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  24.02 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  22.39 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  22.39 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  22.39 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.410744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>