18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2936 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2936  peroxidase  100 
 
 
714 aa  1454    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  26.58 
 
 
1650 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  27.59 
 
 
2342 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  28.04 
 
 
1625 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  27.18 
 
 
2342 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  26.71 
 
 
3587 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  26.59 
 
 
3587 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  26.68 
 
 
3619 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  26.9 
 
 
3094 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  26.68 
 
 
3619 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  25.69 
 
 
3608 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  25.96 
 
 
1712 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  25.29 
 
 
2950 aa  75.5  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2669  heme peroxidase  26.16 
 
 
610 aa  64.3  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2500  Animal heme peroxidase  24.55 
 
 
648 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6498  Animal heme peroxidase  23.29 
 
 
969 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2396  heme peroxidase  29.06 
 
 
535 aa  47.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1624  heme peroxidase  23.3 
 
 
528 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.127392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>