24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2315 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  89.33 
 
 
75 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  63.93 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  58.06 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  61.54 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  46.67 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  46.67 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  46.67 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  61.54 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  65.38 
 
 
103 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  56.6 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2131  hypothetical protein  57.45 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3040  hypothetical protein  50.88 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.754474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3486  hypothetical protein  55.81 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0203743  normal  0.534669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  48.28 
 
 
61 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  43.4 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  40.98 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16270  hypothetical protein  46.3 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.020473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  46.15 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  44.23 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  43.33 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4901  hypothetical protein  52.27 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  38.89 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2652  hypothetical protein  46.67 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441179  normal  0.0488909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>