22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2307 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2307  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  256  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2155  hypothetical protein  87.1 
 
 
163 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995978  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6968  hypothetical protein  64.1 
 
 
122 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.151467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  60.15 
 
 
292 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3731  hypothetical protein  59.5 
 
 
132 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612226  normal  0.022429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2787  hypothetical protein  60.53 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.502157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  51.49 
 
 
287 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  53.12 
 
 
305 aa  87.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3265  hypothetical protein  44.96 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3635  hypothetical protein  50.41 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 
291 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  51.46 
 
 
335 aa  73.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1244  hypothetical protein  39.76 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214862  decreased coverage  0.000603891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1414  hypothetical protein  46.15 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234715  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12007  hypothetical protein  42.75 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000940488  normal  0.526902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  41.35 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.549907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3499  hypothetical protein  36.77 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  40.87 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  40.87 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1997  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3941  hypothetical protein  40.57 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00759865  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0833  hypothetical protein  42.97 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.567086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>