16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2178 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  627  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  62.88 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  64.94 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  69.61 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  57.5 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  58.19 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  53.21 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  57.78 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  54.78 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  51.76 
 
 		 305 aa  265  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  51.08 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  43.08 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.79 
 
 		 951 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  31.22 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  29.38 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4969  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>