23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1603 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1854  hypothetical protein  64.6 
 
 		 610 aa  781    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1777  hypothetical protein  64.49 
 
 		 608 aa  786    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00185901  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2146  hypothetical protein  55.47 
 
 		 637 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2682  hypothetical protein  64.49 
 
 		 608 aa  786    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000455476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1949  hypothetical protein  55.73 
 
 		 618 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000191587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2470  hypothetical protein  58.96 
 
 		 620 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000205608  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2607  hypothetical protein  64.49 
 
 		 608 aa  785    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000464347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1635  hypothetical protein  64.07 
 
 		 609 aa  793    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0185934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1815  hypothetical protein  56.49 
 
 		 617 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000383708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2567  hypothetical protein  62.32 
 
 		 611 aa  751    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00371664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1603  hypothetical protein  100 
 
 		 625 aa  1276    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00349835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1604  hypothetical protein  66.03 
 
 		 607 aa  801    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915226  normal  0.134718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2658  hypothetical protein  57.7 
 
 		 629 aa  700    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1610  hypothetical protein  66.4 
 
 		 608 aa  811    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.179059  normal  0.203284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1543  hypothetical protein  65.45 
 
 		 608 aa  788    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0643256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2467  hypothetical protein  56.22 
 
 		 624 aa  699    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000132009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2007  hypothetical protein  29.06 
 
 		 565 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0554485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3276  hypothetical protein  27.47 
 
 		 613 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1429  hypothetical protein  28.57 
 
 		 576 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0373606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  27.69 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003441  hypothetical protein  25.6 
 
 		 558 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00037914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02334  hypothetical protein  25.53 
 
 		 577 aa  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1554  hypothetical protein  27.31 
 
 		 554 aa  45.8  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0365139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>