25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2007 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2007  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1135    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0554485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1429  hypothetical protein  43.49 
 
 		 576 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0373606  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3276  hypothetical protein  29.75 
 
 		 613 aa  190  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2607  hypothetical protein  29.83 
 
 		 608 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000464347  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1777  hypothetical protein  30.06 
 
 		 608 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00185901  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2682  hypothetical protein  30.06 
 
 		 608 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000455476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1635  hypothetical protein  29.81 
 
 		 609 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0185934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1543  hypothetical protein  29.53 
 
 		 608 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0643256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1610  hypothetical protein  30.19 
 
 		 608 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.179059  normal  0.203284 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2567  hypothetical protein  29.1 
 
 		 611 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00371664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1854  hypothetical protein  30.65 
 
 		 610 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1604  hypothetical protein  28.77 
 
 		 607 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915226  normal  0.134718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2470  hypothetical protein  28.3 
 
 		 620 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000205608  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2467  hypothetical protein  29.86 
 
 		 624 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000132009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2658  hypothetical protein  29.59 
 
 		 629 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2146  hypothetical protein  27.59 
 
 		 637 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1815  hypothetical protein  30.65 
 
 		 617 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000383708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1949  hypothetical protein  28.23 
 
 		 618 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000191587  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1603  hypothetical protein  29.16 
 
 		 625 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00349835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2280  hypothetical protein  28.9 
 
 		 612 aa  63.9  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0821111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02334  hypothetical protein  27.6 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003441  hypothetical protein  27.08 
 
 		 558 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1554  hypothetical protein  29.34 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0365139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  27.67 
 
 		 363 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1092  hypothetical protein  27.45 
 
 		 564 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.480484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>