18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3192 on replicon NC_008036
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008036  Sala_3192  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0436  putative conjugual transfert protein, traC  54.21 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2654  putative conjugal transfert protein, TraC  52.78 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0271  putative conjugal transfert protein, TraC  52.78 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0638011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2275  hypothetical protein  51.85 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65326  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0441  putative conjugal transfert protein, TraC  52.38 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618371  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0099  hypothetical protein  58.33 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0995  hypothetical protein  50.93 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43164  decreased coverage  0.00000531254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4519  hypothetical protein  60.49 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0148  hypothetical protein  54.44 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.586949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3949  hypothetical protein  51.85 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3229  hypothetical protein  55.95 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1544  hypothetical protein  51.06 
 
 		 112 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185841  normal  0.304828 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4225  hypothetical protein  51.06 
 
 		 112 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1151  hypothetical protein  56.04 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0125186  hitchhiker  0.0000023633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0179  hypothetical protein  51.49 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3572  hypothetical protein  51.19 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.120151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0327  putative conjugal transfert protein, TraC  63.51 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>