18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2586 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  332  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2581  hypothetical protein  32.86 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.24 
 
 
155 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.24 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  27.48 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  33.93 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  31.2 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  31.19 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  27.42 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  27.42 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  30.77 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  26.19 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  26.96 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 
319 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  28.12 
 
 
135 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  25.81 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.49 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  26.13 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>